🎓 Defensa de tesis doctoral

📅 Viernes, 10 de octubre de 2025
🕥 10:40 h
📍 Sala de Juntas, ETS de Ingeniería de Telecomunicación – Universidad de Málaga
🎟️ Entrada libre hasta completar aforo

🧑‍🎓 Doctoranda

Elena María Espinosa García

🧑‍🏫 Dirección

Óscar Plata y Rafael Larrosa
(Departamento de Arquitectura de Computadores, Universidad de Málaga – IMECH.UMA)

📖 Resumen

Los avances en las tecnologías de secuenciación han mejorado notablemente la precisión y viabilidad de los ensamblajes genómicos. Paralelamente, el desarrollo de nuevas estructuras de datos, algoritmos eficientes y técnicas computacionales ha permitido abordar los retos de este campo. Sin embargo, el de novo assembly continúa requiriendo importantes recursos de cómputo y sigue siendo un área de investigación activa, con métodos y estrategias en constante evolución.

Esta tesis realiza un estudio exhaustivo del ensamblaje genómico de novo y sus principales cuellos de botella. A partir de este análisis, se proponen soluciones tanto a nivel de software como de hardware para acelerar el proceso y hacerlo más eficiente energéticamente. El trabajo incluye una revisión completa del estado del arte, un análisis comparativo de los ensambladores más utilizados y el desarrollo de dos herramientas de aceleración: SeqMatcher y GenTEK.

La defensa de esta tesis se realiza en el Departamento de Arquitectura de Computadores de la Universidad de Málaga y se enmarca dentro de las líneas de investigación del Instituto Universitario de Investigación en Mecatrónica y Sistemas Ciberfísicos (IMECH.UMA).